在医疗器械经营许可证办理的过程中，可能会遇到一些难点和需要注意的事项：

医疗器械法规复杂，不同类别的医疗器械（一类、二类、三类）有不同的管理要求和办理流程。企业需要充分理解相关法规，确保符合所有规定。

对于二类和三类医疗器械，企业需要建立较为完善的质量管理体系。这可能包括制定合适的管理制度、操作规程、质量控制流程等。

申请材料需要详尽且符合要求。准备过程中可能会遇到各种问题，如文件格式、证明文件的获取、特定申请表格的填写等。

对于二类和三类医疗器械，现场审查是一个重要环节。企业需要确保经营场所、仓库等设施符合规定的条件。

审批流程可能较为复杂，需要一定时间。企业应有耐心，并准备好在需要时补充或更新资料。

获得医疗器械经营许可证后，企业需要接受持续的监管，包括定期检查、质量管理体系运行的合规性等。

不同地区的具体实施规定可能有所不同，企业需要根据所在地区的具体要求进行申请。

在医疗器械经营许可证办理中，可能需要专业咨询或聘请专业机构协助，特别是在质量管理体系的建立和文件准备方面。而作为专业的第三方认证机构——CIO合规保证组织为企业可提供医疗器械经营许可证核发办理业务，辅导企业一次性通过现场检查，顺利拿证。需要办理可私信。

企业在申请和经营过程中应诚实守信，不得提供虚假材料或信息。

建议在办理前与当地食品药品监督管理局或其他相关部门进行充分沟通，确保了解最新的要求和流程。同时，可以参考已经成功办理的企业经验，或寻求专业的第三方医药咨询机构的帮助。