互联网药品信息服务申请流程是指企业向相关部门提交申请，经过审核、审批、颁发许可证等一系列步骤，获得从事互联网药品信息服务合法经营的资格。具体流程如下：

一、准备资料：

提出申请的企业应当准备好企业基本情况、经营范围、组织机构和人员情况、技术保障、质量控制等相关资料。

二、在线申请：

企业可登录国家药品监督管理局网站，在线填写申请表，上传相关资料。

三、审核资料：

国家药品监督管理局对申请材料进行初步审核，如发现资料不完整或者不符合要求的，将通知企业补充或重新提交。

四、现场检查：

审核通过后，国家药品监督管理局将组织现场检查，检查范围包括企业场所设施、药品信息发布平台、数据安全保障等方面。

五、审批：

通过现场检查后，国家药品监督管理局将对企业申请进行审批，如无问题，将颁发药品互联网信息服务许可证。

六、补全材料和改正违法行为：

企业获得药品互联网信息服务许可证后，应当依据有关法律法规履行各项义务，如发现许可证内容发生变化，应当及时向国家药品监督管理局申请变更。此外，企业在运营过程中如存在违法行为，应当及时改正并向国家药品监督管理局报告。

总之，企业要想从事互联网药品信息服务合法经营，必须通过严格的申请流程，严格遵守各项法规和规定，合法经营，确保消费者权益。